DNA Academy
2026/2027 · UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK
BIF401
UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK · TEK HÜCRELİ OMİKLER & EPİGENOMİK

Tek Hücreli Transkriptomik ve Epigenomik Veri Analizleri

scRNA-SEQ · scATAC-SEQ · HVG · KÜMELEME · MARKER GEN · PSEUDOTIME

BIF401, tek hücreli transkriptomik ve epigenomik veri setlerini hücresel heterojenlik ve kromatin erişilebilirliği ekseninde uygulamalı bir çerçevede ele alır. Katılımcılar tek hücreli veri yapılarının ön işlenmesi ve kalite kontrolünden normalizasyon, HVG seçimi, boyut indirgeme, kümeleme, hücre tipi belirleme ve marker gen analizine; ardından trajektori (pseudotime) ve scATAC-Seq tabanlı kromatin erişilebilirliği analizlerine uzanan iş akışlarını uygular. scRNA-Seq ve scATAC-Seq çıktılarını birlikte biyolojik olarak yorumlar ve raporlanabilir sonuçlara dönüştürür.

Tek Hücreli Omikler scRNA-Seq scATAC-Seq QC Normalizasyon HVG Boyut İndirgeme Kümeleme Hücre Tipi Marker Gen Pseudotime
ATLAS/01 · TEK HÜCRELİ TRANSKRİPTOM & EPİGENOM ANALİZ MİMARİSİ
HÜCRESEL HETEROJENLİK · İFADE · KROMATİN ERİŞİLEBİLİRLİĞİ
01 · TEK HÜCRELİ İFADE: QC'DEN HÜCRE TİPİNE
Tek Hücre QC
Hücre Filtreleme
Normalizasyon · HVG
Boyut İndirgeme
Kümeleme
Hücre Tipi · Marker Gen
02 · TRAJEKTORİDEN KROMATİN ERİŞİLEBİLİRLİĞİNE
Pseudotime
Hücresel Durum Geçişleri
scATAC-Seq
Kromatin Erişilebilirliği
Bütünleşik Yorum
Görselleştirme
TEK HÜCRELİ VERİYİ QC VE FİLTRELEMEYLE HAZIRLA · NORMALİZASYON VE HVG SEÇİMİYLE ÖZELLİK UZAYINI KUR · KÜMELEME VE MARKER GENLERLE HÜCRE TİPLERİNİ TANIMLA · PSEUDOTIME VE scATAC-SEQ İLE DURUM GEÇİŞLERİNİ VE KROMATİN ERİŞİLEBİLİRLİĞİNİ İNCELE · SONUÇLARI BÜTÜNLEŞİK OLARAK YORUMLA
BIF401 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
01
07 MAR
Tek Hücreli Veri Yapıları ve Kalite Kontrol
Tek hücreli omik teknolojilerinden hücre filtrelemeye
01
Eğitim Programının Tanıtımı, Giriş - Tek Hücreli Omik Teknolojilere Bakış
02
Tek Hücreli Veri Yapıları ve Ön İşleme
03
scRNA-Seq Kalite Kontrolü ve Hücre Filtreleme
02
14 MAR
Normalizasyondan Hücre Tipi Belirlemeye
HVG seçimi, boyut indirgeme, kümeleme ve marker genler
04
Normalizasyon ve Özellik (HVG) Seçimi
05
Boyut İndirgeme ve Kümeleme
06
Hücre Tipi Belirleme ve Marker Gen Analizi
03
21 MAR
Trajektori ve Tek Hücreli Epigenomik
Pseudotime analizinden scATAC-Seq erişilebilirlik sinyaline
07
Trajektori (Pseudotime) Analizi
08
scATAC-Seq ve Tek Hücreli Epigenomik Analize Giriş
09
scATAC-Seq Analizi
04
28 MAR
Bütünleşik Yorum, Görselleştirme ve Raporlama
İfade ve kromatin erişilebilirliği sonuçlarının birlikte okunması
10
scRNA-Seq ve scATAC-Seq Sonuçlarının Birlikte Yorumlanması
11
Görselleştirme ve Raporlama
12
Tipik Hataların Değerlendirilmesi ve Kapanış
KAZANIM

Katılımcılar, tek hücreli veri matrislerinde kalite kontrol ve hücre filtreleme kararlarını uygular; normalizasyon ve HVG seçimi sonrasında boyut indirgeme ve kümeleme gerçekleştirir, marker genlerden hücre tiplerini tanımlar. Trajektori (pseudotime) analiziyle hücresel durum geçişlerini, scATAC-Seq verileriyle kromatin erişilebilirliği örüntülerini inceler; scRNA-Seq ve scATAC-Seq çıktılarını bütünleşik olarak yorumlayıp raporlanabilir görselleştirmelere dönüştürür. Modül sonunda, tek hücreli transkriptomik ve epigenomik analiz akışlarını araştırma sorularıyla ilişkilendirerek uçtan uca yürütebilir.

BIF401 · EĞİTMEN / 03
Eğitmen
Önder Akyün
Sistem Biyoloğu · Bağımsız Araştırmacı
GENOMİK · BİYOİNFORMATİK · MULTİ-OMİK · SİSTEM BİYOLOJİSİ
BIF401 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LINKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

BIF401'e Katılın
Tek hücreli transkriptomik ve epigenomik verileri uygulamalı iş akışları içinde analiz edin; QC ve hücre filtrelemeden normalizasyon, HVG seçimi, kümeleme ve hücre tipi belirlemeye, pseudotime ve scATAC-Seq ile kromatin erişilebilirliği analizine uzanan hattı biyolojik yorumla tamamlayın.
KAYIT SAYFASINA GİT →