NARDO Biyoteknoloji
DeltaPulse · Ar-Ge Programı
Çevresel ve Biyolojik Veri Entegrasyonu Üzerine Bir Ar-Ge Programı

DeltaPulse; iklim, hidroloji, habitat ve biyolojik topluluk verilerini aynı araştırma sorusu içinde ele alan bir Ar-Ge çalışmasıdır. Program şu anda yöntem geliştirme, veri entegrasyonu ve pilotlama aşamasındadır.

Proje Yapısı

DeltaPulse hangi problemi ele alıyor?

Çalışmanın odağında, farklı kaynaklardan gelen çevresel ve biyolojik verilerin aynı mekânsal ve zamansal bağlamda birlikte incelenmesi var. Her pilot çalışma kendi araştırma sorusu, veri seti ve kullanım senaryosu üzerinden kuruluyor.

01 / PROBLEM

Problem ve Kapsam

Araştırma sorusu, hipotez, çalışma alanı ve zaman aralığı.

02 / VERİ

Veri Kaynakları

Açık veri, saha gözlemleri, uzaktan algılama ve gerektiğinde moleküler veri.

03 / YÖNTEM

Analiz ve Doğrulama

Model seçimi, parametreler, duyarlılık analizleri ve doğrulama planı.

04 / KARAR

Proje Çıktısı

Bulgular, belirsizlik düzeyi, yorum sınırı ve kullanım senaryosu.

Bu yapı, farklı pilot alanlarda aynı Ar-Ge hattının karşılaştırılabilir biçimde yürütülmesi için kullanılıyor.
Proje Bileşenleri

Dört Ana Çalışma Bileşeni

Mevcut Ar-Ge çerçevesi; çevresel baskı, habitat durumu, biyolojik yanıt ve karar desteği olmak üzere dört ana bileşen üzerine kurulu.

P

Baskı

İklim, hidroloji, arazi kullanımı, kirlilik ve diğer insan kaynaklı müdahaleler.

D

Durum

Su yüzeyi, vejetasyon, habitat bütünlüğü, parçalanma ve ekolojik bağlantısallık.

Y

Yanıt

Tür toplulukları, işlevsel gruplar, moleküler sinyaller ve ekolojik kararlılık göstergeleri.

K

Karar

Doğrulama, belirsizlik, güven düzeyi, yorum sınırları ve araştırma ya da uygulama öncelikleri.

Araştırma Akışı

Pilot Çalışmalar İçin Kullanılan Ortak Çalışma Akışı

Pilot çalışmalar problem tanımı, kapsam, veri, yöntem, doğrulama ve çıktı olmak üzere altı ana aşama üzerinden planlanıyor.

01

Problem

Araştırılabilir soru ve hipotez.

02

Sınır

Mekânsal ve zamansal kapsam.

03

Veri

Kaynak, çözünürlük ve uygunluk.

04

Yöntem

Algoritma, parametre ve kontrol.

05

Doğrulama

Çapraz denetim ve duyarlılık.

06

Çıktı

Raporlama ve karar desteği.

Veri Katmanları

Projede Kullanılan Veri Katmanları

Veri seti pilot çalışmaya göre değişiyor. Mevcut çerçevede iklim, hidroloji, habitat, biyoçeşitlilik ve moleküler veri olmak üzere beş ana katman bulunuyor.

01 / İKLİM

İklimsel Baskılar

Sıcaklık ve yağış düzeylerinin yanı sıra zamansal oynaklık ve aşırı olaylar.

  • Kuraklık ve Anomaliler
  • Mevsimsellik
  • Ölçek Uyumu
02 / HİDROLOJİ

Hidrolojik Dinamikler

Taşkın, çekilme ve su yüzeyi dinamiklerinin habitatla ilişkisi.

  • Su Rejimi
  • Taşkın ve Çekilme
  • Zamansal Eşleşme
03 / HABİTAT

Habitat Yapısı ve Bağlantısallık

Alan büyüklüğünün ötesinde süreklilik, kenar etkisi ve parçalanma.

  • Arazi Örtüsü
  • Vejetasyon
  • Bağlantısallık
04 / BİYOÇEŞİTLİLİK

Biyolojik Topluluklar

Tek tür kayıtlarının ötesinde topluluk kompozisyonu, işlevsel gruplar ve kararlılık.

  • Tür Gözlemleri
  • Topluluk Yapısı
  • İşlevsel Göstergeler
05 / MOLEKÜLER

Moleküler Veri

Araştırma sorusunun gerektirdiği durumlarda eDNA, mikrobiyom ve metagenomik veri katmanları.

  • Örnekleme Tasarımı
  • Referans Veri Tabanı Sınırları
  • Kontaminasyon Kontrolü
Açık veri, DeltaPulse’ın veri kaynaklarından biri. Kaynak, dönem, çözünürlük ve örnekleme yapısı her veri seti için ayrıca kaydediliyor.
Yöntem Kaydı

Analiz Kaydı ve Doğrulama Bilgisi

VERİ

Kaynak · Dönem · Çözünürlük · Eksiklikler · Örnekleme Yanlılığı

YÖNTEM

Algoritma · Parametre · Eşik · Alternatif Model · Duyarlılık

YORUM

Korelasyon–nedensellik Ayrımı · Genelleme Sınırı · Belirsizlik

KULLANIM

Kullanım Senaryosu · Güven Düzeyi · Yorum Sınırı

Karar Destek Prototipi

Karar Destek Prototipi

Arayüz şu anda kavramsal prototip aşamasında. İlk tasarım; çevresel göstergeler, veri kaynağı, doğrulama durumu ve belirsizlik bilgisini aynı çalışma ekranında topluyor.

DELTAPULSE / ARAŞTIRMA PROTOTİPİVERİ KAYNAĞI · DOĞRULAMA DURUMU · YORUM SINIRI
Habitat ve Hidroloji Haritası
Baskı ve Anomali Profili
Biyolojik Yanıt ve Güven
Baskı Paneli

İklimsel ve Hidrolojik Göstergeler · Dönem · Ölçek · Veri Kalitesi

Habitat Paneli

Su Yüzeyi · Vejetasyon · Parçalanma · Bağlantısallık

Biyolojik Panel

Gözlemsel Kayıtlar · Moleküler Sinyaller · Topluluk Göstergeleri

Yöntem Paneli

Veri Kaynağı · Kalite Kontrol · Belirsizlik · Yorum Sınırı

Pilot Çalışma

Kızılırmak Deltası

Yöntem Geliştirme ve Veri Entegrasyonu İçin İlk Saha Bağlamı

Kızılırmak Deltası, DeltaPulse kapsamında ilk pilot çalışma alanı olarak planlanıyor. Çalışma; iklim ve hidroloji verilerinin habitat ve biyolojik topluluk verileriyle aynı zaman–mekân çerçevesinde incelenmesine odaklanıyor.

01Su Rejimi ve Habitat Geometrisi
02Habitat Sürekliliği ve Topluluk Kararlılığı
03Gözlemsel ve Moleküler Biyolojik Sinyaller
04Doğrulama, Belirsizlik ve Kullanım Sınırı

Pilot çalışma henüz Ar-Ge ve prototipleme aşamasındadır.

Araştırma Eksenleri

Pilot Çalışmanın Araştırma Soruları

A / BASKI

İklimsel ve hidrolojik baskılar hangi zaman ve mekân ölçeklerinde belirginleşiyor?

Günlük oynaklık, mevsimsellik ve uzun dönem eğilimlerinin karşılaştırılması.

B / HABİTAT

Habitat alanındaki kayıp ile işlev kaybı arasındaki farkı nasıl ölçebiliriz?

Alan büyüklüğü, parçalanma, süreklilik, bağlantısallık ve kenar etkilerinin birlikte incelenmesi.

C / BİYOLOJİK YANIT

Topluluk kararlılığını hangi göstergelerle izleyebiliriz?

Taksonomik kompozisyon, işlevsel gruplar, gözlemsel kayıtlar ve gerektiğinde moleküler sinyaller.

D / KARAR

Bir göstergeyi karar desteğinde kullanmak için hangi doğrulama ve güven ölçütlerine ihtiyaç var?

Doğrulama, veri kalitesi, güven düzeyi ve kullanım sınırı.

Ar-Ge Çalışma Paketleri

Ar-Ge Çalışma Planı

Mevcut geliştirme planı dört çalışma paketinden oluşuyor.

WP–01

Problem ve Kapsam Tanımı

Araştırma sorusu ve hipotez; mekânsal ve zamansal sınırlar; karar kullanıcısı ve kullanım senaryosu.

WP–02

Veri ve Üst Veri Denetimi

Kaynak keşfi, veri erişimi ve uyumlandırma; kalite kontrol, örnekleme boşlukları ve veri izlenebilirliği.

WP–03

Gösterge ve Model Geliştirme

Baskı, habitat ve biyolojik yanıt göstergeleri; alternatif modeller ve duyarlılık analizleri.

WP–04

Doğrulama ve Prototipleme

Çapraz veri denetimi, belirsizlik haritaları, kullanıcı senaryoları ve karar destek prototipi.

İş Birliği Alanları

DeltaPulse disiplinlerarası iş birliklerine açık.

Projenin mevcut iş birliği alanları; saha çalışması, ekoloji, moleküler biyoloji, uzaktan algılama, veri analizi, modelleme ve doğrulama çalışmalarını kapsıyor.

Üniversiteler

Akademik Araştırma Grupları ve Merkezler

Hipotez geliştirme, saha tasarımı, ekolojik ve genomik analizler, biyoçeşitlilik değerlendirmesi ve yöntem doğrulama.

Kamu

Ar-Ge Birimleri, Devlet ve Referans Laboratuvarları

İzleme ihtiyaçları, veri sürekliliği, karar senaryoları, doğrulama ve kurumsal uygulama bağlamı.

Özel Sektör

Biyoteknoloji, Çevre, Veri ve Analiz Ekipleri

Teknoloji geliştirme, veri mühendisliği, ölçüm altyapısı, prototipleme ve ölçekleme.

Saha Ortakları

Koruma, İzleme ve Uygulama Ekipleri

Yerel bilgi, örnekleme koşulları, habitat erişimi, saha doğrulaması ve kullanıcı ihtiyaçları.

Hesaplamalı Bilim

CBS (GIS), Uzaktan Algılama ve Modelleme

Mekânsal analiz, zaman serisi analizi, ağ ve bağlantısallık modellemesi ile istatistiksel ve makine öğrenmesi yöntemleri.

Moleküler Katman

eDNA, Mikrobiyom ve Metagenomik

Araştırma sorusuna göre eDNA, mikrobiyom ve metagenomik örnekleme; wet lab – dry lab süreçleri ve referans veri tabanı sınırları.

DeltaPulse Ar-Ge İş Birliği

Veri ortaklığı, pilot saha, yöntem geliştirme veya prototipleme kapsamında proje görüşmeleri için bizimle iletişime geçebilirsiniz.

NARDO Biyoteknoloji · Araştırma ve GeliştirmeProblem → Veri → Yöntem → Doğrulama → Karar Desteği