DNA Academy
2026/2027 · İLERİ BİYOİNFORMATİK & MULTİ-OMİK
BIF601
İLERİ BİYOİNFORMATİK · MULTİ-OMİK MODELLEME · AÇIKLANABİLİRLİK

Multi-omik Modelleme ve Açıklanabilir Makine Öğrenimi

VALIDASYON · XAI · GENELLENEBİLİRLİK

BIF601, biyolojik ve multi-omik verilerde modellemeyi; araştırma sorusunun model hedefi ve özellik uzayına çevrilmesi, sızıntısız veri ayrımı, model seçimi, validasyon, açıklanabilirlik ve genellenebilirlik kararlarının birlikte yönetildiği uygulamalı bir süreç olarak ele alır. Katılımcılar Google Colab üzerinde referans ve ağaç tabanlı modeller kurar; özellik seçimi, çapraz doğrulama ve uygun performans metrikleriyle modeli değerlendirir; Partial Dependence ve SHAP ile model davranışını inceler.

Problem Çerçevesi Sızıntısız Veri Ayrımı Random Forest Gradient Boosting Özellik Seçimi Çapraz Doğrulama Partial Dependence SHAP Genellenebilirlik
ATLAS/01 · BİYOLOJİK SORUDAN AÇIKLANABİLİR VE GENELLENEBİLİR MODELE
PROBLEM · MODEL · VALIDASYON · XAI · GENELLENEBİLİRLİK
01 · PROBLEM ÇERÇEVESİNDEN GÜVENİLİR MODELE
Biyolojik Soru
Hedef · Sınıf · Sonuç
Veri & Özellikler
Multi-omik Matris
Model
RF · Gradient Boosting
02 · VALIDASYONDAN AÇIKLAMAYA VE BİYOLOJİK YORUMA
Validasyon
CV · Metrikler
XAI
PDP · SHAP
Biyolojik Yorum
Genellenebilirlik
BİYOLOJİK SORUYU MODEL HEDEFİNE DÖNÜŞTÜR · VERİYİ SIZINTISIZ AYIR · MODELİ KUR VE VALIDASYONLA SINA · PDP/SHAP İLE AÇIKLA · SONUÇLARI BİYOLOJİK BAĞLAM VE GENELLENEBİLİRLİK SINIRLARIYLA YORUMLA
BIF601 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
01
09 MAY
Biyolojik Sorudan Modelleme Problemine
Biyolojik sorudan model hedefi ve özellik uzayına, veri ayrımından sızıntısız değerlendirmeye
01
Biyolojik Soruyu Model Hedefi ve Özellik Uzayına Dönüştürmek
02
Veri Ayrımı ve Sızıntısız Değerlendirme: Eğitim, Validasyon ve Test
03
İlk Referans Model: Sınıflandırma, Regresyon ve Baseline Mantığı
02
16 MAY
Model Kurmak ve Güvenilirliğini Sınamak
Ağaç tabanlı modellerden özellik seçimine, performans ölçümünden validasyona
04
Ağaç Tabanlı Modeller: Decision Tree, Random Forest ve Gradient Boosting
05
Özellik Seçimi ve Yüksek Boyutlu Omik Veride Model Karmaşıklığı
06
Model Validasyonu: Metrikler, Çapraz Doğrulama ve Hiperparametre Ayarı
03
23 MAY
Model Tahmininden Açıklamaya: XAI
Model davranışını özellik katkıları, yerel açıklamalar ve tepki profilleri üzerinden incelemek
07
Model Açıklanabilirliği ve XAI: Ne Açıklıyoruz, Ne Açıklamıyoruz?
08
Global Açıklama: Özellik Önemi ve Partial Dependence
09
Lokal Açıklama: SHAP ile Tekil Tahminleri Okumak
04
30 MAY
Model Sınırlarından Biyolojik Yoruma
Performanstan genellenebilirliğe, açıklamadan uçtan uca multi-omik yoruma
10
Derin Öğrenme: Omik Veride Ne Zaman Gerekli, Ne Zaman Gereksiz?
11
Model Genellenebilirliği, Dayanıklılık ve Bağımsız Değerlendirme
12
Multi-omik Veriyle Uçtan Uca Modelleme, Açıklama ve Biyolojik Yorum
KAZANIM

Katılımcılar, biyolojik bir araştırma sorusunu model hedefi ve özellik uzayına dönüştürür; veri ayrımını ve model değerlendirme akışını veri sızıntısını önleyecek biçimde kurar. Google Colab üzerinde referans ve ağaç tabanlı modeller geliştirir; özellik seçimi, çapraz doğrulama ve uygun metriklerle model performansını değerlendirir. Partial Dependence ve SHAP ile global ve lokal model davranışını inceler; açıklamaların nedensel yorumla eşdeğer olmadığını gözeterek sonuçları biyolojik bağlamla ilişkilendirir. Modül sonunda multi-omik veri üzerinde modelleme, validasyon, açıklama ve genellenebilirlik değerlendirmesi adımlarını uçtan uca yürütebilir.

BIF601 · EĞİTMENLER / 03
Eğitmenler
Dr. Neslihan Gökmen
Bilgisayar Bilimleri · Araştırmacı ve Akademisyen
MODELLEME · VALIDASYON · XAI
Önder Akyün
Sistem Biyoloğu · Bağımsız Araştırmacı
OMİK VERİ · BİYOLOJİK BAĞLAM · SİSTEM YORUMU
BIF601 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LİNKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

BIF601'e Katılın
Biyolojik soruyu güvenilir bir modelleme problemine dönüştürün; sızıntısız veri ayrımı, validasyon, Partial Dependence ve SHAP ile model davranışını açıklayın ve sonuçları genellenebilirlik sınırları içinde biyolojik bağlama taşıyın.
KAYIT SAYFASINA GİT →