DNA Academy
2026/2027 · UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK
PYT101
HESAPLAMALI VE ANALİTİK TEMELLER · PYTHON & BİYOİNFORMATİK

Python’a Giriş

KODDAN TEKRARLANABİLİR BİLİME: GENOMİK VERİYE UYGUN PRATİK ÇÖZÜMLER

PYT101, genomik veriyi işlemek için gereken programlama altyapısını sıfırdan kurar ve doğrudan biyoinformatik iş akışlarına bağlar. Google Colab üzerinde Python temellerinden veri yapılarına; FASTA/FASTQ işlemeden Biopython’a, Pandas ve NumPy ile veri yönetiminden VCF filtreleme, görselleştirme, otomasyon ve GitHub tabanlı tekrarlanabilir çalışma akışlarına uzanan uygulamalı bir öğrenme hattı sunar.

Python Google Colab FASTA / FASTQ Biopython Pandas NumPy VCF Otomasyon GitHub
ATLAS/01 · PYTHON & BİYOİNFORMATİK PROGRAMLAMA MİMARİSİ
KOD · SEKANS VERİSİ · TABLOSAL VERİ · TEKRARLANABİLİRLİK
01 · PYTHON TEMELLERİNDEN SEKANS VERİSİNE
Google Colab
Python Temelleri
Veri Yapıları
Fonksiyonlar · Dosyalar
FASTA / FASTQ
Biopython SeqIO
02 · VERİ YÖNETİMİNDEN TEKRARLANABİLİR İŞ AKIŞINA
Pandas · NumPy
Tablo · Matris
VCF
Filtrele · Özetle
Görselleştirme · Otomasyon
GitHub
COLAB ÜZERİNDE PYTHON TEMELLERİNİ KUR · FASTA / FASTQ VERİSİNİ OKU VE İŞLE · BIOPYTHON İLE STANDART SEKANS İŞ AKIŞI KUR · PANDAS / NUMPY İLE VERİYİ YÖNET · VCF ÇIKTILARINI FİLTRELE VE ÖZETLE · KODU OTOMASYON VE GITHUB İLE TEKRARLANABİLİR BİR ANALİZ AKIŞINA DÖNÜŞTÜR
PYT101 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
01
11 EKİ
Geliştirici Ortamı ve Python Temelleri
Google Colab’dan temel Python sözdizimine
01
Geliştirici Ortamı: Google Colab ve Çalışma Düzeni
02
Python Temelleri — Değişkenler, Veri Tipleri ve Koşullar
03
String Metodları ve Metin İşleme
02
12 EKİ
Veri Yapıları, Döngüler ve Genomik Veriyle İlk Temas
Python veri yapılarından FASTA üzerinde ilk uygulamaya
04
Listeler, Tuple, Set ve Dictionary Yapıları
05
Döngüler
06
FASTA Dosyasını Manuel Okumak — Uzunluk ve GC İçeriği
03
18 EKİ
Dosya İşleme ve Biopython ile Standart İş Akışı
Fonksiyonlardan SeqIO ile FASTA/FASTQ işlemeye
07
Fonksiyonlar ve Dosya İşleme — Try/Except, Okuma/Yazma, String
08
FASTQ Parse: Manuel Satır Satır → Biopython SeqIO Karşılaştırması
09
Biopython SeqIO ile FASTA/FASTQ İşleme
04
19 EKİ
Pandas, NumPy ve VCF: Büyük Veriyi Yönetmek
Tablosal ve matris verisinden varyant çıktılarına
10
Pandas Temelleri — DataFrame, Filtreleme, Gruplama ve İstatistik
11
VCF Çıktısını Okumak, Filtrelemek ve Özetlemek
12
NumPy — Matris Yapısı ve Genomik Veride Kullanımı
05
23 EKİ
Görselleştirme, Otomasyon ve Tekrarlanabilir Açık Bilim
Analiz çıktısından rapora ve GitHub tabanlı otomasyona
13
Görselleştirme
14
Otomasyon
15
Kapanış Projesi: QC Raporu Üretmek ve GitHub’a Push Etmek
KAZANIM

Katılımcılar, Python ile genomik veriyi okuyabilen, düzenleyebilen, filtreleyebilen ve özetleyebilen tekrarlanabilir bir çalışma hattı kurar. Google Colab üzerinde FASTA/FASTQ dosyalarını işler; Biopython SeqIO ile sekans verisini yönetir; Pandas ve NumPy ile veri yapılarını analiz eder; VCF çıktıları üzerinde filtreleme, görselleştirme ve otomasyon adımlarını uygular. Modül sonunda, biyoinformatik veri işleme problemlerini Python ile bağımsız olarak çözebilecek, kodlarını yeniden kullanılabilir biçimde düzenleyebilecek ve GitHub üzerinde paylaşılabilir bir analiz akışı oluşturabilecek uygulama yeterliliği kazanır.

PYT101 · EĞİTMEN / 03
Eğitmen
Dr. Neslihan Gökmen
Bilgisayar Bilimleri · Araştırmacı ve Akademisyen
PYTHON · İSTATİSTİKSEL ÖĞRENME · VERİ GÖRSELLEŞTİRME · TIBBİ YAPAY ZEKÂ
PYT101 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LINKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

PYT101'e Katılın
Python temellerini doğrudan genomik veriyle kurun; FASTA/FASTQ ve VCF verilerini işleyin, Biopython, Pandas ve NumPy ile uygulamalı veri analizi yapın ve GitHub üzerinde paylaşılabilir tekrarlanabilir bir biyoinformatik çalışma akışı oluşturun.
KAYIT SAYFASINA GİT →