DNA Academy
2026/2027 · UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK
BIF201
UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK · GENOMİK İŞ AKIŞLARI

Genomik Veri Analizleri

KISA VE UZUN OKUMA VERİLERİNDE QC · HİZALAMA · IGV · VARYANT ANALİZİ · ANOTASYON

BIF201, BIF101’de edinilen temelleri gerçek kısa-okuma (NGS) ve uzun-okuma (3. nesil) verileri üzerinde uçtan uca genomik analiz pratiğine dönüştürür. Katılımcılar kalite kontrol, hizalama, BAM/kapsama değerlendirmesi, IGV incelemesi, varyant çağrımı, filtreleme ve anotasyon adımlarını uygulayarak kısa ve uzun okuma iş akışlarının analitik kararlarını karşılaştırmalı olarak öğrenir.

Kısa Okuma Uzun Okuma QC Hizalama BAM Kapsama IGV BCFtools GATK Varyant Analizi Anotasyon
ATLAS/01 · UÇTAN UCA GENOMİK ANALİZ İŞ AKIŞI
GERÇEK VERİ · GOOGLE COLAB · UYGULAMALI İŞ AKIŞI
01 · HAM VERİDEN REFERANS ÜZERİNDE OKUMAYA
Ham Veri
Kısa · Uzun Okuma
QC · Filtreleme
Veri Tipine Uygun Karar
Hizalama
BAM · Kapsama · IGV
02 · VARYANTTAN BİYOLOJİK YORUMA
Varyant Çağrımı
BCFtools
Filtreleme · Normalizasyon
IGV Doğrulaması
Anotasyon
Biyolojik Yorum
VERİ TİPİNİ TANI · QC VE FİLTRELEME KARARINI VER · KISA / UZUN OKUMAYI HİZALA · BAM KALİTESİ VE KAPSAMAYI İNCELE · IGV İLE GÖRSEL DOĞRULAMA YAP · VARYANTLARI ÇAĞIR, FİLTRELE VE ANOTE ET · TEKNİK ÇIKTIYI BİYOLOJİK YORUMA TAŞI
BIF201 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
01
25 EKİ
Ham Veriden Analize: Kısa ve Uzun Okuma Hazırlığı
Veri formatı, QC ve veri tipine uygun filtreleme kararları
01
Genomik Analiz Karar Zinciri ve BIF101’den BIF201’e Geçiş
02
Ham Veri ve Genomik Veri Formatları
03
Kalite Kontrolü, Trimming ve Filtreleme
02
01 KAS
Hizalamadan BAM Kalitesine: Referans Üzerinde Veriyi Okumak
Kısa/uzun okuma hizalama, BAM QC, kapsama ve görsel inceleme
04
Kısa ve Uzun Okuma Verilerinin Hizalanması
05
Hizalama Sonrası BAM QC ve Kapsama Analizi
06
IGV ile Hizalama ve Kapsama İncelemesi
03
08 KAS
Varyant Analizi: Çağırma, Filtreleme ve Fonksiyonel Yorum
Varyant çağrımı, filtreleme, IGV doğrulaması ve anotasyon
07
Varyant Çağrımı (Variant Calling)
08
Varyant Filtreleme, Normalizasyon ve IGV ile Aday Varyant İncelemesi
09
Varyant Anotasyonu ve Biyolojik Yorumlama
04
15 KAS
GATK ve Uçtan Uca Genomik Analiz
GATK ekosistemi ve kısa/uzun okuma iş akışlarının bütünleştirilmesi
10
GATK Ekosistemi ve Varyant Analizi Yaklaşımları
11
Uçtan Uca Genomik Veri Analizi - Short Read
12
Uçtan Uca Genomik Veri Analizi - Long Read
KAZANIM

Katılımcılar, kısa-okuma ve uzun-okuma genomik verilerini QC ve filtrelemeden hizalama, BAM kalite ve kapsama değerlendirmesi, IGV incelemesi, varyant çağrımı, filtreleme ve anotasyona uzanan uçtan uca bir iş akışında analiz eder. BCFtools tabanlı varyant hattını uygular, GATK ekosisteminin yöntemsel konumunu kavrar ve teknik çıktıları biyolojik yoruma taşır. Bu modül, tek başına uygulanabilir bir genomik veri analizi yetkinliği kazandırır; ileri düzey fonksiyonel genomik veri analizleri için de sağlam bir altyapı oluşturur.

BIF201 · EĞİTMEN / 03
Eğitmen
Önder Akyün
Sistem Biyoloğu · Bağımsız Araştırmacı
GENOMİK · BİYOİNFORMATİK · VARYANT ANALİZİ · SİSTEM BİYOLOJİSİ
BIF201 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LINKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

BIF201'e Katılın
Kısa ve uzun okuma genomik verilerini gerçek veri üzerinde uçtan uca analiz edin; QC, hizalama, BAM/kapsama değerlendirmesi, IGV, varyant çağrımı, filtreleme ve anotasyon adımlarını bütünlüklü bir genomik iş akışında uygulayın.
KAYIT SAYFASINA GİT →