DNA Academy
2026/2027 · UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK
BIF301
UYGULAMALI BİYOİNFORMATİK · FONKSİYONEL GENOMİK

İleri Düzey Fonksiyonel Genomik Veri Analizleri

BULK RNA-SEQ · CHIP-SEQ · ATAC-SEQ · DİFERANSİYEL İFADE · PEAK ANALİZİ

BIF301, bulk RNA-Seq ve epigenomik veri setleri üzerinden ileri düzey fonksiyonel genomik analizleri uygulamalı bir çerçevede ele alır. Katılımcılar kalite kontrol ve hizalamadan read counting, diferansiyel gen ifade analizi, peak calling, anotasyon ve fonksiyonel zenginleştirmeye uzanan iş akışlarını Google Colab üzerinde uygular; transkriptomik ve epigenomik sinyalleri birlikte biyolojik olarak yorumlar.

Bulk RNA-Seq ChIP-Seq ATAC-Seq QC Hizalama Read Counting Diferansiyel İfade Peak Calling Anotasyon Fonksiyonel Zenginleştirme Yolak Analizi
ATLAS/01 · BULK RNA-SEQ & EPİGENOMİK ANALİZ MİMARİSİ
GERÇEK VERİ · GOOGLE COLAB · UYGULAMALI İŞ AKIŞI
01 · RNA-SEQ: HAM VERİDEN DİFERANSİYEL İFADEYE
Ham Veri · QC
Hizalama
→
Read Counting
Sayım Tablosu
→
DE Analizi
Görselleştirme
02 · EPİGENOMİK SİNYALDEN FONKSİYONEL YORUMA
ChIP-Seq · ATAC-Seq
Epigenomik Veri
→
Peak Calling
Anotasyon
→
Zenginleştirme · Yolak
Biyolojik Yorum
VERİ TÜRÜNÜ VE ARAŞTIRMA SORUSUNU TANIMLA · QC VE HİZALAMA ADIMLARINI YÜRÜT · RNA-SEQ SAYIM TABLOSUNU OLUŞTUR VE DİFERANSİYEL İFADEYİ HESAPLA · CHIP-SEQ / ATAC-SEQ SİNYALİNDE PEAK CALLING VE ANOTASYON UYGULA · BULGULARI FONKSİYONEL ZENGİNLEŞTİRME VE YOLAK ANALİZİYLE BİYOLOJİK BAĞLAMA TAŞI
BIF301 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
4 HAFTA · 12 DERS
06 · 13 · 20 · 27 ARALIK 2026 · 12 SAAT CANLI
01
06 ARA
RNA-Seq ve Epigenomik Veri Yapılarına Giriş
Bulk veri türlerinden kalite kontrol kararlarına
01
Eğitim Programının Tanıtımı, Genel Bilgilendirme, Giriş
02
RNA-Seq ve Epigenomik Veri Türlerine Giriş
03
Kalite Kontrol (QC) Uygulaması
02
13 ARA
RNA-Seq: Hizalamadan Diferansiyel İfadeye
Hizalama, read counting ve diferansiyel gen ifade hesabı
04
RNA-Seq Hizalama Uygulaması
05
Read Counting (Sayım Tablosu Oluşturma)
06
Diferansiyel Gen İfade Analizi (DE) - Hesaplama
03
20 ARA
İfade Desenlerinden Epigenomik Sinyale
DE görselleştirme, ChIP-Seq / ATAC-Seq ve peak analizi
07
Diferansiyel Gen İfadesinin Görselleştirilmesi
08
Epigenomik Analize Giriş (ChIP-Seq / ATAC-Seq)
09
Peak Calling ve Anotasyon
04
27 ARA
Fonksiyonel Yorum ve Uçtan Uca Analiz
Yolak analizinden bütünleşik sonuç değerlendirmesine
10
Fonksiyonel Zenginleştirme ve Yolak Analizi
11
Uçtan Uca Analiz ve Görselleştirme
12
Uçtan Uca Analiz ve Görselleştirme, Değerlendirme ve Kapanış
KAZANIM

Katılımcılar, bulk RNA-Seq verilerinde diferansiyel gen ifade analizi gerçekleştirir; ChIP-Seq ve ATAC-Seq verilerinde peak calling ve anotasyon uygular. RNA-Seq ve epigenomik çıktıları fonksiyonel zenginleştirme ve yolak analizleriyle biyolojik olarak yorumlar, sonuçları raporlanabilir görselleştirmelere dönüştürür. Modül sonunda fonksiyonel genomik analiz akışlarını araştırma sorularıyla ilişkilendirerek uçtan uca yürütebilir.

BIF301 · EĞİTMEN / 03
Eğitmen
FONKSİYONEL GENOMİK · TRANSKRİPTOMİK
EPİGENOMİK · BİYOLOJİK YORUM
Önder Akyün
Sistem Biyoloğu · Bağımsız Araştırmacı
GENOMİK · BİYOİNFORMATİK · MULTİ-OMİK · SİSTEM BİYOLOJİSİ
EĞİTMEN PROFİLİ → ORCID ↗ LINKEDIN ↗
BIF301 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript
TÜRKÇE · ENGLISH
DOĞRULANABİLİR BELGE

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LINKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

BIF301'e Katılın
Bulk RNA-Seq, ChIP-Seq ve ATAC-Seq verilerini uygulamalı iş akışları içinde analiz edin; diferansiyel ifade, peak calling, anotasyon, fonksiyonel zenginleştirme ve yolak analizi çıktılarından biyolojik olarak yorumlanabilir sonuçlar üretin.
KAYIT SAYFASINA GİT →
DNA Academy
dnaacademy.com.tr · nardobiotech.com
info@dnaacademy.com.tr · +90 549 502 13 14