DNA Academy
2026/2027 · İLERİ BİYOİNFORMATİK & MULTİ-OMİK
HMB601
İLERİ BİYOİNFORMATİK · HOLO-OMİK ENTEGRASYON · SİSTEM BİYOLOJİSİ

Holobiont Multi-omik Biyoinformatik

KONAK · MİKROBİYOM · METABOLOM · SİSTEM DÜZEYİ SENTEZİ

HMB601, konak, mikrobiyom ve metabolom katmanlarını örnekleme geometrisi ve zaman ölçekleriyle birlikte ele alan holo-omik bir analiz çerçevesi sunar. Katılımcılar, HMP2/IBDMDB'nin işlenmiş veri ürünlerini Google Colab üzerinde kullanarak boylamsal mikrobiyom-metabolom ve kesitsel konak-mikrobiyom analiz evrenlerini kurar; kompozisyonellik, tekrarlı ölçüm ve küçük örneklem çıkarımı gibi temel metodolojik sorunları veri üzerinde değerlendirir. HAllA ve MOFA tabanlı entegrasyon yaklaşımlarıyla çok katmanlı ilişkileri inceler, bulguları biyolojik bağlama taşır ve nedensellik sınırlarını tartışır.

HMP2 / IBDMDB Holo-omik Örnek Eşleştirme CLR Karışık Modeller HAllA MOFA Sistem Biyolojisi
ATLAS/01 · ÇOK KATMANLI BİYOLOJİK VERİDEN SİSTEM DÜZEYİ YORUMA
KONAK · MİKROBİYOM · METABOLOM · HOLO-OMİK ENTEGRASYON
HOLO-OMİK ANALİZ HATTI
Konak + Mikrobiyom
+ Metabolom
→
Örnek Eşleştirme
Zaman · Analiz Evreni
→
Kompozisyonellik
Tekrarlı Ölçüm
Karışık Modeller
+ HAllA
→
MOFA
Ortak Varyasyon
→
Bütüncül
Biyolojik Yorum
KONAK · MİKROBİYOM · FONKSİYON / METABOLİTLER · HOLO-OMİK ENTEGRASYON · SİSTEM YORUMU
HMB601 · ÖĞRENME MİMARİSİ / 02
Program İçeriği
5 HAFTA · 15 DERS
06–27 HAZİRAN + PANEL OTURUMU · 15 SAAT CANLI
01
06 HAZ
Holobiont Çerçevesi ve HMP2 Veri Mimarisi
Analiz evrenlerini katılımcı, örnek, ölçüm türü ve zaman eksenlerinde kurmak; eşleştirme penceresinin örnek kazanımı, zamansal yakınlık ve kohort bileşimi üzerindeki etkisini okumak
01
Holobiont, Hologenom ve Holo-omik: Analiz Birimi Nedir?
02
HMP2 Veri Mimarisi: Katılımcı · Örnek · Ölçüm Türü · Zaman
03
Eşleştirilmiş Örnek Nedir? İki Analiz Evreninin Kurulması
02
13 HAZ
Evren A · Boylamsal Mikrobiyom-Metabolom
Boylamsal mikrobiyom ve metabolom yapısını kompozisyonellik, birey-içi değişim ve tekrarlı ölçüm geometrisiyle birlikte çözümlemek
04
Mikrobiyom Verisi: Kompozisyonellik, Filtreleme ve CLR
05
Mikrobiyal Fonksiyon ve Metabolom: Katmanlar Arası Biyolojik Köprü
06
Birey-içi Değişim ve Tekrarlı Ölçümler: Karışık Modeller
03
20 HAZ
Evren B · Konak-Mikrobiyom Kesiti ve Küçük Örneklemde Çıkarım
Konak katmanını biyopsi bölgesi, örnek eşleştirme geometrisi ve küçük örneklem sınırları içinde mikrobiyom/metabolomla ilişkilendirmek
07
Başlangıç Konak Transkriptomu: Anatomik Bölge ve Önceden Tanımlı Konak İmzaları
08
Konak ↔ Mikrobiyom ↔ Metabolom: Katmanlar Arası İlişki Analizi
09
Küçük Örneklemde Çıkarım: Etki Büyüklüğü, Çoklu Test ve Duyarlılık
04
27 HAZ
Holo-omik Entegrasyon ve Sistem Durumları
Aynı biyolojik sistemi çok aşamalı ve eşzamanlı entegrasyon stratejileriyle karşılaştırmalı olarak modellemek ve yorumlamak
10
Çok Aşamalı ve Eşzamanlı Entegrasyon: Hangi Soru İçin Hangisi?
11
Boylamsal Omikler Arası Entegrasyon: Karışık Model Artıkları + HAllA
12
MOFA ile Ortak Varyasyon Örüntüleri ve Konak Katmanıyla Biyolojik Destek
05
PANEL
Bitirme Projesi · Savunma · Epistemik Kapanış
Canlı uygulamaların ardından yürütülen proje çalışma dönemi; tarihi katılımcılarla birlikte planlanan panel oturumunda HMP2 veri paketi üzerinde sunum ve analitik karar savunması
13
HMP2 Analitik Karar Projesi: Ortak Veri Paketi Üzerinde Farklı Analitik Dallar
14
Analitik Kararların Savunulması ve Bulguların Biyolojik Yorumu
15
İlişkiden Mekanizmaya: Hastalık Nedenselliği ve Holobiont Sınırları
KAZANIM

Katılımcılar, holo-omik analizi veri tablolarının teknik birleşiminin ötesinde; örnek eşleştirme, analiz evreni seçimi, tekrarlı ölçüm modelleme ve entegrasyon kararlarının birlikte kurulduğu bir sistem biyolojisi problemi olarak edinir. Konak, mikrobiyom, metabolom ve klinik/fenotipik meta-veri arasındaki ilişkileri kompozisyonellik, katılımcı etkisi, küçük örneklem çıkarımı, ortak varyasyon örüntüleri ve nedensellik sınırlarıyla birlikte değerlendirebilir.

HMB601 · EĞİTMEN / 03
Eğitmen
MİKROBİYOM · METAGENOMİK
SİSTEM BİYOLOJİSİ
Önder Akyün
Sistem Biyoloğu · Bağımsız Araştırmacı
MİKROBİYOM · METAGENOMİK · SİSTEM BİYOLOJİSİ
EĞİTMEN PROFİLİ → ORCID ↗ LINKEDIN ↗
HMB601 · SERTİFİKASYON / 04
Başarı Sertifikası ve Transkript
TÜRKÇE · ENGLISH
DOĞRULANABİLİR BELGE

İKİ DİLDE BELGE

Modülü tamamlayan katılımcıya Türkçe ve İngilizce başarı sertifikası ile modül ders içeriğini gösteren transkript verilir.

DOĞRULANABİLİR

Her iki belge aynı benzersiz sertifika numarasını taşır ve DNA Academy Sertifikasyon Sistemi üzerinden doğrulanabilir.

LİNKEDIN ENTEGRASYONU

Sertifika LinkedIn profilinin lisans ve sertifikalar bölümüne eklenebilir ve profesyonel profilde paylaşılabilir.

HMB601'e Katılın
Konak, mikrobiyom ve metabolom katmanlarını HMP2/IBDMDB verileri üzerinde örnekleme geometrisi, zaman, tekrarlı ölçüm ve entegrasyon kararlarıyla birlikte ele alın; HAllA ve MOFA ile çok katmanlı ilişkileri sistem düzeyinde yorumlayın.
KAYIT SAYFASINA GİT →
DNA Academy
dnaacademy.com.tr · nardobiotech.com
info@dnaacademy.com.tr · +90 549 502 13 14